近年來，節省能源、安全可靠、效果好、成本低的包裝食品殺菌技術相繼得到開發和應用，大大促進了包裝食品的生產與發展。

輻照殺菌技術：是利用放射線同位素鈷60、銫157產生的γ-射線或低能加速器放射出的β-射線對包裝食品進行輻照處理。加拿大、以色列、法國、日本等國家普遍使用放射物質鈷60，它放射出的強力γ射線可徹底摧毀細菌的遺傳因子，徹底破壞他們的生理活性，使用高劑量時幾乎可以消滅任何細菌。

輻照完全殺菌：將密封包裝后的食品以2500～5000千拉德輻照，能使所有損壞食品的致病性微生物死滅，從而達到商品消毒目的。輻照前可在食品中加入食鹽和三磷酸鈉等，能減少食品的水分損失，又能增強射線對細菌的殺傷能力。經輻照完全殺菌法處理后的牛肉、雞肉、火腿、豬肉、香腸、魚蝦等在常溫(21℃～38℃)下能貯藏2年以上，可保持色香味佳。

輻照消毒殺菌：劑量100～1000千拉德，可有效地限制有損大眾健康的生物及致敗性微生物生長，能有效清除對高蛋白質食品如肉類、乳制品、蛋制品危害極大的沙門氏菌，用50萬拉德照射，就能使之成億倍減少，也能殺死冷凍食品深處的沙門氏菌。現全世界已有20多個國家批準應用輻照殺菌的食品供人類食用，如雞肉、豬肉、鮮魚、蘑菇、香料、土豆、大米、洋蔥、小麥等。輻照食品安全可靠，經世界各國40多年實踐證明，輻照食品從未發現有放射性物質殘留，能保持原有質量和色香味。在美國，輻照食品已帶上太空，宇航員食用后證明對身體也無害。輻照食品的優點是保藏期長，照射一次可保鮮數年，既殺死細菌，又抑制與延緩食品本身的新陳代謝，消除了食品變質根源。輻照殺菌可節省大量能量，任何食物用輻照法殺菌后僅采用普通包裝便可貯藏，省去大量制罐、冷凍冷藏等材料以及能量，以輻照保藏已可代替部分冰箱。

紫外線照射：紫外線照射即利用紫外線殺傷目標微生物的DNA，使之發生化學變化形成嘧啶二聚物，以破壞遺傳因子而失去繁殖能力或死亡，殺菌效果以250～260nm最強。國外研制的強力紫外燈，照射強度達200mw/cm2，為高性能紫外線裝置，對包裝材料殺菌安全有效。

固體表面殺菌器：將包裝好的食品通過傳送帶，送入照射軌道內，用殺菌燈滅菌處理，然后用傳送帶送出。適用于塑料薄膜包裝的食品，要求包裝材料用光線穿透率好的聚乙烯或聚丙烯塑料薄膜。

液體殺菌器：可分兩種，有外部照射的外部照射式和讓水及液體從內部流過的內部照射式。殺菌效果可以從初始濃度經照射后達到零。

紫外線殺菌：紫外線殺菌不需或只需少量添加殺菌劑和防腐劑，比加熱處理及過濾殺菌法省能、成本低，維護簡便，使用安全可靠，殺菌后不損害食品香味及光澤等優點，應用較廣泛。美國先后開發了系列產品，放射量比過去大數十倍的紫外燈已經實用化，已可逐漸用于透射。紫外線殺菌如配合加熱、過氧化氫、熱檸檬酸溶液、乙醇、超聲波等處理方法，效果則更好。

微波殺菌：微波殺菌就是用微波使水分子發生振動，利用分子產生的摩擦熱進行殺菌。適用于導熱不良的食品和因加熱而易降低品質的食品。對于采用塑料包裝材料的食品，能在包裝原狀下，短時間內從食品中心加熱殺菌，還能防止二次污染。